Giải bóng đá Các đội mạnh Toàn quốc 1990 là mùa giải thứ 9 của giải đấu bóng đá hạng cao nhất Việt Nam và là mùa giải đầu tiên giải mang tên gọi Giải bóng đá Các đội mạnh Toàn quốc. 18 đội bóng tham dự thi đấu qua ba giai đoạn, gồm 2 vòng bảng và vòng loại trực tiếp để chọn ra đội vô địch và 3 đội bóng xuống hạng A1 mùa giải năm sau.[2]Kết thúc giải đấu, Câu lạc bộ Quân đội giành được chức vô địch từ tay Đồng Tháp. Tiền vệ Nguyễn Hồng Sơn của đội đoạt danh hiệu vua phá lưới với 10 bàn thắng ghi được. Công nhân Xây dựng Hà Nội, Sông Lam Nghệ Tĩnh và Tiền Giang là ba đội phải xuống hạng cùng với Dệt Nam Định bị ban tổ chức loại trực tiếp do để xảy ra sự cố hành hung trọng tài ở vòng 1. Nhưng sau đó, cả 4 đội được giữ lại ở giải các đội mạnh và tiếp tục thi đấu ở mùa giải 1991, trừ Dệt Nam Định chỉ có thể trở lại từ mùa giải 1992.[3]